افغانستان با بزرگ‌ترین تهدیدی که حکومت طالبان با آن روبه‌رو است، نه از بیرون بلکه از درون مواجه می‌باشد. بر اساس گزارش تفصیلی اخیر بی‌بی‌سی، یک فایل صوتی افشا شده و یک سال تحقیق نشان داده است که در میان رهبری عالی طالبان اختلافات عمیق وجود دارد؛ اختلافاتی که به گفتهٔ خود رهبر طالبان، هبت‌الله آخندزاده، می‌تواند به «پایان امارت اسلامی» منجر شود.
این فایل صوتی در جنوری ۲۰۲۵ در یکی از مدارس قندهار هنگام سخنرانی آخندزاده برای اعضای طالبان ضبط شده بود، جایی که او نسبت به جناح‌های مخالف در داخل حکومت هشدار داده است.
در این فایل، آخندزاده به‌صراحت می‌گوید که تقسیمات داخلی می‌تواند امارت را نابود کند. این سخنان شایعاتی را که ماه‌ها دربارهٔ اختلافات در میان رهبران طالبان جریان داشت، تقویت کرد؛ هرچند سخنگویان طالبان همواره این اختلافات را رد کرده‌اند.
تحقیق یک‌سالهٔ بی‌بی‌سی نشان داد که در میان طالبان دو جناح متضاد وجود دارد: جناح قندهاری که وفادار به آخندزاده است و خواهان یک نظام سخت‌گیر اسلامی با کنترل کامل روحانیون بر جامعه می‌باشد؛ و جناح کابلی که شامل وزرای قدرتمند طالبان است و رویکردی عمل‌گرایانه‌تر دارد، با هدف برقراری روابط با جامعهٔ جهانی و فراهم کردن دسترسی محدود زنان به آموزش و کار.
مسئلهٔ زنان مهم‌ترین نقطهٔ اختلاف میان دو جناح است. در سپتامبر ۲۰۲۵، آخندزاده دستور قطع اینترنت و تلفن را صادر کرد، اما وزرای کابلی با فشار بر نخست‌وزیر، این خدمات را دوباره برقرار کردند؛ اقدامی که به‌عنوان مخالفت عملی با دستور رهبر طالبان تلقی شد.
با وجود این اختلافات، احتمال شورش آشکار اندک است، زیرا اطاعت در درون طالبان اصل اساسی شمرده می‌شود. سخنگوی طالبان، ذبیح‌الله مجاهد، گزارش بی‌بی‌سی را «بی‌اساس» خوانده و تأکید کرده است که در صفوف امارت اسلامی هیچ اختلافی وجود ندارد و همه امور بر اساس شریعت اداره می‌شود