میان پاکستان و افغانستان، موضوع حضور ادعایی تحریک طالبان پاکستان (TTP) بار دیگر شدت گرفته است. بر اساس ادعاها، یکی از نزدیکان امیر معاویه کاظم، فرمانده ارشد TTP که در چندین حمله دست داشته، در افغانستان کشته شده است.
بر اساس موضع پاکستان، حضور فرماندهان TTP در افغانستان همچنان یک تهدید امنیتی جدی محسوب می‌شود. در اکتوبر ۲۰۲۵، برای دستگیری کاظم ۱۰ کروڑ روپیه جایزه تعیین شده بود.
ولایت کنر افغانستان پیش از این نیز به دلیل فعالیت‌های TTP در خبرها مطرح بوده است. در دسامبر ۲۰۲۴، گزارش‌هایی درباره کشته‌شدن چندین فرمانده، از جمله فرمانده ارشد شاهد عمر باجوړی، در این ولایت منتشر شده بود.
پاکستان ادعا می‌کند که TTP از خاک افغانستان برای انجام حملات استفاده می‌کند؛ ادعایی که حکومت طالبان افغانستان آن را رد می‌کند. در جولای ۲۰۲۶، در یک حمله انتحاری به یک پوسته بازرسی در تانک، ۱۵ نیروی امنیتی کشته شدند و ارتش پاکستان مسئولیت این حمله را متوجه TTP دانست. در واکنش، پاکستان حملات هوایی علیه مواضعی در افغانستان انجام داد که مقام‌های افغان مدعی شدند در نتیجه آن شماری از غیرنظامیان کشته شده‌اند.
حضور ادعایی TTP در کنر به یکی از موضوعات مهم مورد اختلاف در روابط پاکستان و افغانستان تبدیل شده است. ادامه حملات و اقدامات تلافی‌جویانه، نگرانی‌ها از افزایش بیشتر تنش‌ها در منطقه را افزایش داده است